Pro sloučení certifikátu (soubor *.spc) a privátního klíče v separátním souboru *.pvk lze jednoduše použít utilitu PVK Digital Certificate Files Importer. Stáhnout lze z microsoft.com. Po stažení je třeba rozbalit a spustit instalátor. Použití je jednoduché, stačí spustit pvkimprt.exe, první parametr je soubor s certifikátem, druhý parametr je soubor s privátním klíčem,viz příklad:

Tady je navíc návod jak podepsat Java aplikaci (JAD a JAR).